Thesis Fungigt: Fungi Genomic Tools plataforma de integración de herramientas genómicas para el análisis de hongos
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Date
2025-07
Authors
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Program
Ingeniería Civil Telemática
Departament
Campus
Campus Casa Central Valparaíso
Abstract
La plataforma FungiTG es una solución integral y optimizada para el análisis genómico y filogenético de hongos, diseñada para superar las limitaciones de las herramientas bioinformáticas tradicionales. Este proyecto integra herramientas avanzadas como BinDash, eggNOG-mapper y Braker3 en un entorno web unificado, permitiendo realizar tareas clave como la anotación genómica, el control de calidad y el análisis funcional de manera eficiente. Gracias a la implementación de tecnologías modernas como contenedores Docker, microservicios y arquitecturas escalables, FungiTG optimiza el procesamiento de grandes conjuntos de datos genómicos y reduce significativamente los tiempos de análisis: de dos días a solo 18 horas. La plataforma prioriza la experiencia del usuario mediante visualizaciones interactivas, como árboles filogenéticos, mapas de calor y diagramas de vías metabólicas, que facilitan la interpretación de resultados complejos. Además, su diseño modular y escalable permite futuras expansiones e integraciones, adaptándose a las necesidades cambiantes de la investigación. FungiTG representa una contribución significativa al campo de la genómica de hongos, ofreciendo una herramienta accesible, robusta y eficiente para investigadores de todo el mundo, al tiempo que mejora la productividad y precisión en el análisis genómico.
Description
Keywords
Análisis genómico, Sistemas distribuidos, Tiempos de análisis, Contenedores Docker