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DESARROLLO DE UN PROTOCOLO DE ANÁLISIS PARA VERIFICAR PATRONES DE COEXISTENCIA Y CO-ABUNDANCIA ENTRE ESPECIES VIRALES Y BACTERIANAS EN MUESTRAS METAGENOMICAS DE AMBIENTES ACUÁTICOS

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dc.contributor.advisorBUIL ARANDA, CARLOS
dc.contributor.authorESCAR SALINAS, RODRIGO ALEJANDRO
dc.contributor.departmentUniversidad Técnica Federico Santa María. Departamento de Informáticaes_CL
dc.contributor.otherORELLANA ROMAN, ROBERTO
dc.coverage.spatialCasa Central Valparaísoes_CL
dc.date.accessioned2020-11-19T19:20:15Z
dc.date.available2020-11-19T19:20:15Z
dc.date.issued2020-08
dc.description.abstractLos virus son los organismos mas abundantes y ubicuos en el planeta. Virus que infectan bacterias son llamados bacteriófagos y son fundamentales en el desarrollo de los ecosistemas que sustentan la vida. El conocimiento sobre los bacteriófagos esta limitado por la dificultad del cultivo de estos en condiciones de laboratorio. Se presenta un protocolo estructurado para hacer uso de diversas herramientas basadas en metagenomica para facilitar el estudio de bacteriófagos en el medio ambiente, consistentes en determinación de presencia de organismos en metagenomas a través de la asignación de unidades taxonómicas operativas (OTU) y la confirmación de relaciones de coexistencias usando variaciones del coeficiente de Jaccard. Se valida un desempeño minimamente suficiente de las herramientas listando la ausencia de información sobre bacteriófagos y sesgo de las bases de datos de referencia como principal causa en los problemas de entrenamiento y validación de las herramientas. Se presenta un análisis de metagenomas de ambientes agua dulce usando el protocolo presentado, limitado a grupos taxonómicos de interés.es_CL
dc.description.degreeINGENIERO CIVIL INFORMÁTICOes_CL
dc.description.programDEPARTAMENTO DE INFORMÁTICA. INGENIERÍA CIVIL INFORMÁTICAes_CL
dc.format.extent102 H.es_CL
dc.identifier.barcode18660217KUTFSM.pdfes_CL
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11673/49661
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBIOINFORMATICAes_CL
dc.subjectMETAGENOMAes_CL
dc.subjectREDESes_CL
dc.subject.otherINGENIERIA CIVIL INFORMATICAes_CL
dc.titleDESARROLLO DE UN PROTOCOLO DE ANÁLISIS PARA VERIFICAR PATRONES DE COEXISTENCIA Y CO-ABUNDANCIA ENTRE ESPECIES VIRALES Y BACTERIANAS EN MUESTRAS METAGENOMICAS DE AMBIENTES ACUÁTICOSes_CL
dc.typeTesis de Pregrado
dspace.entity.typeTesis
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Tesis de Pregrado de Acceso Abierto