Desarrollo de una interfaz de visualización de imágenes médicas para el diagnóstico en oncología de precisión

Abstract

El biomarcador Ki-67 es un indicador relevante en la prognosis del cáncer de mama; sin embargo, el conteo y cálculo de su índice de proliferación constituye un proceso costoso y demandante. En este trabajo se propone una interfaz y dos pipelines complementarios: uno orientado a la generación de nuevos datasets a partir de anotaciones nucleares mediante la extracción de parches positivos, negativos y de fondo, y otro destinado a la inferencia, realizando el conteo de instancias Ki-67 positivas y negativas y la estimación del índice de proliferación. La interfaz gráfica permite visualizar explícitamente las segmentaciones y clasificaciones realizadas, aportando explicabilidad visual al usuario. La interfaz funciona por defecto utilizando Cellpose SAM y un clasificador ConvNeXt-Tiny entrenado sobre el dataset público BCData, alcanzando un F1-score global de 84.17% y un RMSE de 0.08076. La interfaz permite el cambio de segmentador y clasificador según sea necesario. En conjunto, el sistema demuestra la utilidad de un MVP extensible y adaptable a otros biomarcadores o tareas de patología digital.