Thesis Applying machine learning in otolaryngology and Gastroenterology: accelerating diagnostics through computer-assisted solutions
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Date
2023-06
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Program
DEPARTAMENTO DE ELECTRÓNICA. DOCTORADO EN INGENIERÍA ELECTRÓNICA (PHD)
Campus
Casa Central Valparaíso
Abstract
Mejorar la práctica médica mediante la inteligencia artificial es una realidad. La evolución
tecnológica ha facilitado la digitalización y optimización de grandes volúmenes de datos,
incrementando a su vez la capacidad de procesamiento informático. Técnicas avanzadas
como el aprendizaje automático y el aprendizaje profundo, ambos subcampos de la inteligencia
artificial, han evolucionado para imitar al cerebro humano y realizar tareas de
interpretación, reconocimiento y clasificación de datos. En medicina, el diagnóstico clínico
es quizá la tarea más crítica en la que puede intervenir la inteligencia artificial porque de
ella depende las decisiones posteriores que ayudarán a recuperar la salud de los pacientes.
Muchas áreas de la medicina utilizan la interpretación de imágenes como fuente principal
de información para realizar un diagnóstico, y para ello se requiere tanto una buena calidad
de imagen como una interpretación precisa y razonable.
Esta tesis propone el uso del diagnóstico –o detección– asistido por computador
como componente clave para mejorar la interpretación de imágenes médicas, así como para
agilizar el proceso diagnóstico, particularmente en aquellas áreas médicas de la atención
primaria que se ven afectadas por la falta de especialistas. Con el objetivo de apoyar la toma
de decisiones clínicas e incrementar la precisión diagnóstica con una confianza comparable
a la de los expertos médicos, el sistema asistido por computador utiliza inteligencia artificial
y se convierte en una herramienta de diagnóstico eficaz y precisa diseñada, implementada y
validada en dos áreas médicas: gastroenterología y otorrinolaringología.
En primer lugar, exploramos el enfoque de aprendizaje basado en características
utilizando descriptores del contenido de la imagen y clasificadores tradicionales de aprendizaje
automático. En gastroenterología, el sistema de detección automático de pólipos
propuesto recibe como entrada una imagen endoscópica extraída del examen de colonoscopia
y determina si la imagen contiene pólipos o no con un rendimiento promedio
superior al 90%. Siguiendo este mismo enfoque, proponemos AMIRA, un sistema de
asistencia al diagnóstico otológico, capaz de clasificar cuatro afecciones del oído a nivel de
imagen. Este sistema puede utilizarse como herramienta de cribado en casos de hipoacusia
conductiva. El sistema AMIRA fue extendido para cubrir hasta nueve patologías del oído
medio y externo, y para ello se adoptó un enfoque de aprendizaje profundo que aborda una
clasificación multiclase más compleja. En esta propuesta se analiza el video completo en
lugar de una sola imagen, emulando el proceso de examinación que el especialista realiza
durante el examen de otoscopia. Introducimos un esquema de aprendizaje híbrido que
explota las ventajas de las redes neuronales convolucionales y recurrentes, considerando
tanto la información espacial como temporal que proporciona el video. AMIRA alcanzó un
alto desempeño, evaluado en un conjunto de prueba, con una precisión media de 91,65%,
sensibilidad media de 89,78%, especificidad media de 98,67% y una puntuación F1 media
de 90,30%. Hasta donde sabemos, AMIRA es el sistema capaz de predecir más diagnósticos
de afecciones del oído conocido hasta la fecha. Los médicos generales o incluso los
especialistas en otorrinolaringología podrían utilizar el sistema propuesto para una mejor
toma de decisiones clínicas al utilizar el resultado que entrega AMIRA como una segunda
opinión objetiva sobre la evaluación diagnóstica de una determinada patología del oído
medio o externo.
Description
Keywords
MACHINE LEARNING, DEEP LEARNING, MEDICAL IMAGE INTERPRETATION, CADX/E