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Influencia de la linealización de la ecuación de Poisson-Boltzmann para la estimación del potencial electroestático y la energía de solvatación

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dc.contributor.advisorCooper Villagrán, Christopher (Profesor Guía)
dc.contributor.advisorZambrano Rodríguez, Harvey Alexander (Profesor Correferente)
dc.contributor.authorVega Lagos, Byron Alexander
dc.contributor.departmentUniversidad Técnica Federico Santa María. Departamento de Ingeniería Mecánicaes_CL
dc.coverage.spatialCasa Central Valparaísoes_CL
dc.date.accessioned2023-11-02T14:28:24Z
dc.date.available2023-11-02T14:28:24Z
dc.date.issued2023-09
dc.description.abstractLa energía de solvatación y el potencial electrostático, son medidas que nos permite entender las interacciones moleculares de una proteína y un medio. Dada la importancia que toma en investigación se requiere ser lo suficientemente minucioso con la forma y las suposiciones que se tomen al momento de entregar resultados. A lo largo de esta memoria de investigación hemos realizado una serie de ensayos sobre distintas moléculas con variadas características, todo con el objetivo de responder cuál es el efecto sobre el potencial tras linealizar la ecuación de Poisson Boltzmann. En consideración de aquello se realizó un minucioso análisis de sensibilidad para cada una de las moléculas presentadas en el estudio, donde se definió que una distancia media de 20 [A] permite asegurar las condiciones de Dirichlet en el contorno. Las moléculas analizadas las separamos en 3 baterías inicialmente, diferenciadas por su nivel de carga. La primera de ellas, denominada altamente cargada, contiene moléculas como la 9ANT, 280D, 437D y 1KX5 de donde concluimos cosas como que el comportamiento del error debido a la diferencia de potencial calculado de la linealización y la no linealización, se acentúa en el interfaz y en zonas relativamente cóncavas a comparación de la proteína, es decir, con cierto grado de cobertura por parte de la molécula. Otro factor de interés es que el error se acentúa mucho más en este tipo de batería de moléculas, pues al compararla con moléculas de menor carga o con ciertas propiedades hidrófobas, es decir que en su composición molecular existan cadenas de lípidos, estos presentan un orden de magnitud mucho mayor en el error, tomando importancia para la investigación el refinado de la malla.es_CL
dc.description.degreeINGENIERO(A) MECÁNICO(A)es_CL
dc.description.programDEPARTAMENTO DE INGENIERÍA MECÁNICA. INGENIERÍA CIVIL MECÁNICAes_CL
dc.format.extent105 Hes_CL
dc.identifier.barcode195243956UTFSMes_CL
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11673/56615
dc.rights.accessRightsAes_CL
dc.subjectPOISSON-BOLTZMANNes_CL
dc.subjectDIFERENCIAS FINITASes_CL
dc.subjectPOTENCIAL ELECTROESTÁTICOes_CL
dc.titleInfluencia de la linealización de la ecuación de Poisson-Boltzmann para la estimación del potencial electroestático y la energía de solvataciónes_CL
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