Muñoz Vargas, Felipe Andrés2026-07-272026-07-272026https://repositorio.usm.cl/handle/123456789/78860Molecular Craft es una plataforma de software para modelado molecular, docking y análisis estructural en el desarrollo de fármacos. Hoy se distribuye como aplicación de escritorio, un modelo que limita su escalabilidad e impide capturar información estructurada sobre el uso de la herramienta. En el marco de su evolución hacia un modelo de Software as a Service (SaaS), este trabajo diseña e implementa un mecanismo concreto para captar y retener una masa crítica de usuarios científicos e institucionales. Ese mecanismo es un asistente agéntico de bioinformática, integrado en una versión web de la búsqueda en el Protein Data Bank. El asistente se construye sobre un grafo de estados que orquesta nodos especializados. Resuelve proteínas y recupera literatura real desde PubMed mediante el Model Context Protocol, vinculando cada publicación a su fuente para reducir alucinaciones. Su aporte central es que, al mediar la interacción, convierte cada consulta en datos estructurados: proteínas consultadas, literatura recuperada y rutas de seguimiento. Esos datos son la materia prima para reconocer patrones de uso, entrenar modelos e impulsar la adopción. Se trata de un estudio aplicado de alcance exploratorio. Su resultado es un asistente funcional, que evidencia cómo la asistencia inteligente puede aportar valor desde el primer uso y proponerse como palanca de captación y retención hacia una futura masa crítica de usuarios.49 páginasesAttribution-NonCommercial 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Modelado molecularSortware científicoMasa críticaAgentes de inteligencia artificialCaptura de datos estructuradosDescubrimiento de fármacosAsistente agéntico35609002924013 Salud y bienestar9 Industria, innovación e infraestructura